冷たく、硬く、無慈悲なスフィア。

愛する弟を探して、少女は終わりの世界をクマのぬいぐるみとともに旅する。

時は20XX年。

突如宇宙から飛来した巨大な金属球《スフィア》。それは大気圏突入後に分裂し、世界各国の首都上空に静止した。やがてそこからさらに小型の金属球が放出され、各国の首都機能は停止した――。