エージェント・イン・ザ・メタバース

　西暦二〇五五年。人々の脳内の世界と電子技術が融合して生み出された仮想世界（メタバース）が普及していたが、そこでは犯罪が多発していた。
　中学一年生の女子である〈遠井イチカ〉は、メタバース内で〈フラム〉というコードネームを持つエージェントとして活動をしていた。エージェントとは、陰からメタバースの平和を守るためにスパイのような仕事をする者を指す言葉である。
　イチカの同級生の男子である〈赤石アオト〉も、メタバース内では〈レーゲン〉というコードネームを持ち、イチカとコンビを組んでエージェントとして活動をしていた。
　射撃の腕に秀でたフラムと、物作りと改造に秀でたレーゲン。
　ある日、そんな二人の元にメタバース内で行方不明になった者たちを捜索する任務が発令される。その任務をこなしている内に二人はとある事件に巻き込まれ…！？