一見αのようにしか見えない畑仲翔（はたなかかける）は、発達性バース適応障害を患うΩ。
生殖器から生成されるバース因子が脳に至らないが故に、翔はα－－特に同性のαに抱かれ、孕まされることに生理的嫌悪を抱いてしまう。
しかし町で偶然出会った彼の「運命の番」は、同じ年の同性のαだった。

「運命のΩだったら、ずっと俺の傍にいてくれる。運命のΩは、けして俺を裏切らない。－－運命のΩなら、今はそうでなくても、きっといつか俺を愛してくれるんだ」

運命の番を見つけた母から捨てられたトラウマ故に、自身の運命のΩに執着する宮本雄大（みやもとゆうだい）は、翔の顔も名前も知らないまま、匂いだけを追って、翔が通う全寮制椿山学園に高等部から入学する。
しかし、椿山学園は「セントラルディスタービングシステム」と呼ばれる、バース感知阻害システムが完備されている学園だった……！

絶対に運命の番から逃げたいΩと、絶対に運命の番を捕まえたいα。
友人となった二人の攻防戦が、今始まる。

※独自バース設定、造語あり